Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U8

Gm8094, Predicted gene 8094, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8094K7N6U8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8094K7N6U8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8094K7N6U8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8094K7N6U8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8094K7N6U8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8094K7N6U8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8094K7N6U8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm8094K7N6U8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm8094K7N6U8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm8094K7N6U8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms