Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Taf4bG5E8Z2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Taf4bG5E8Z2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Taf4bG5E8Z2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Taf4bG5E8Z2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Taf4bG5E8Z2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Taf4bG5E8Z2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Taf4bG5E8Z2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Taf4bG5E8Z2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms