Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab11fip2G3XA57 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rab11fip2G3XA57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11fip2G3XA57 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab11fip2G3XA57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rab11fip2G3XA57 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11fip2G3XA57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip2G3XA57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip2G3XA57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms