Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgxb3G3X9M3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Hmgxb3G3X9M3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmgxb3G3X9M3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgxb3G3X9M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hmgxb3G3X9M3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hmgxb3G3X9M3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms