Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20517G3UVU6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm20517G3UVU6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm20517G3UVU6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm20517G3UVU6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm20517G3UVU6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms