Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20604F8WIA3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20604F8WIA3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20604F8WIA3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm20604F8WIA3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20604F8WIA3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms