Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pira2F8VQ94 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pira2F8VQ94 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pira2F8VQ94 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pira2F8VQ94 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pira2F8VQ94 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pira2F8VQ94 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pira2F8VQ94 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms