Protein–RNA interactions for Protein: F7AEC7

Gm2832, Predicted gene 2832 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2832F7AEC7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2832F7AEC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm2832F7AEC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm2832F7AEC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm2832F7AEC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm2832F7AEC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm2832F7AEC7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm2832F7AEC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm2832F7AEC7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm2832F7AEC7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm2832F7AEC7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm2832F7AEC7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms