Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5861F6VCN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5861F6VCN9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5861F6VCN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5861F6VCN9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5861F6VCN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm5861F6VCN9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5861F6VCN9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5861F6VCN9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5861F6VCN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5861F6VCN9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5861F6VCN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5861F6VCN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms