Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610001J05RikF2Z3Y9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2610001J05RikF2Z3Y9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms