Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prss56F2YMG0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prss56F2YMG0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prss56F2YMG0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prss56F2YMG0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prss56F2YMG0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prss56F2YMG0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms