Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2610021A01RikE9Q0Q3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms