Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ryr1E9PZQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ryr1E9PZQ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ryr1E9PZQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms