Protein–RNA interactions for Protein: E9PXX9

Slc28a1, Sodium/nucleoside cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a1E9PXX9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc28a1E9PXX9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc28a1E9PXX9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc28a1E9PXX9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc28a1E9PXX9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc28a1E9PXX9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc28a1E9PXX9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc28a1E9PXX9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms