Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rdh8D3Z6W3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh8D3Z6W3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rdh8D3Z6W3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rdh8D3Z6W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdh8D3Z6W3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh8D3Z6W3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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