Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930467E23RikD3Z1P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
4930467E23RikD3Z1P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
4930467E23RikD3Z1P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930467E23RikD3Z1P8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930467E23RikD3Z1P8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930467E23RikD3Z1P8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930467E23RikD3Z1P8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms