Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc170D3YXL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc170D3YXL0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc170D3YXL0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc170D3YXL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc170D3YXL0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc170D3YXL0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc170D3YXL0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms