Protein–RNA interactions for Protein: D3YX71

Gm8973, Predicted gene 8973, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8973D3YX71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm8973D3YX71 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm8973D3YX71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm8973D3YX71 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm8973D3YX71 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm8973D3YX71 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm8973D3YX71 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm8973D3YX71 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm8973D3YX71 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms