Protein–RNA interactions for Protein: D3YWW5

Rtl10, Retrotransposon Gag-like 10, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl10D3YWW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtl10D3YWW5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rtl10D3YWW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl10D3YWW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl10D3YWW5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rtl10D3YWW5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl10D3YWW5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl10D3YWW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rtl10D3YWW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms