Protein–RNA interactions for Protein: B2RWS6

Ep300, Histone acetyltransferase p300, mousemouse

Predictions only

Length 2,412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep300B2RWS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep300B2RWS6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep300B2RWS6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep300B2RWS6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep300B2RWS6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep300B2RWS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ep300B2RWS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ep300B2RWS6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ep300B2RWS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ep300B2RWS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ep300B2RWS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ep300B2RWS6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ep300B2RWS6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms