Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brpf3B2KF05 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brpf3B2KF05 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Brpf3B2KF05 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brpf3B2KF05 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brpf3B2KF05 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brpf3B2KF05 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Brpf3B2KF05 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brpf3B2KF05 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brpf3B2KF05 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms