Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Xlr4aA2BI40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xlr4aA2BI40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Xlr4aA2BI40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Xlr4aA2BI40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Xlr4aA2BI40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xlr4aA2BI40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms