Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SktA2AQ25 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SktA2AQ25 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SktA2AQ25 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SktA2AQ25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SktA2AQ25 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SktA2AQ25 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SktA2AQ25 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SktA2AQ25 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SktA2AQ25 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SktA2AQ25 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SktA2AQ25 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SktA2AQ25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SktA2AQ25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SktA2AQ25 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SktA2AQ25 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SktA2AQ25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms