Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hacd4A2AKM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Hacd4A2AKM2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hacd4A2AKM2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hacd4A2AKM2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hacd4A2AKM2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hacd4A2AKM2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms