Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grin3aA2AIR5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Grin3aA2AIR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin3aA2AIR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Grin3aA2AIR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Grin3aA2AIR5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Grin3aA2AIR5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Grin3aA2AIR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grin3aA2AIR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms