Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fbf1A2A870 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbf1A2A870 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbf1A2A870 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fbf1A2A870 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fbf1A2A870 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fbf1A2A870 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fbf1A2A870 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fbf1A2A870 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fbf1A2A870 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms