Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trbv23A0A0A6YWQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trbv23A0A0A6YWQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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