Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28510A0A087WP28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm28510A0A087WP28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28510A0A087WP28 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28510A0A087WP28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28510A0A087WP28 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28510A0A087WP28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28510A0A087WP28 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28510A0A087WP28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28510A0A087WP28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28510A0A087WP28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm28510A0A087WP28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28510A0A087WP28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms