Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpv2Q9WTR1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpv2Q9WTR1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms