Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NipblQ6KCD5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NipblQ6KCD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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