Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn13Q64512 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ptpn13Q64512 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Ptpn13Q64512 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptpn13Q64512 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms