Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Foxd1Q61345 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Foxd1Q61345 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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