Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prdm6Q3UZD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prdm6Q3UZD5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms