Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Siah2Q06986 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms