Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif3aP28741 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms