Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cox4i1P19783 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cox4i1P19783 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms