Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BckdkO55028 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BckdkO55028 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BckdkO55028 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms