Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chil3O35744 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chil3O35744 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms