Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
6030445D17RikE9Q8F9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
6030445D17RikE9Q8F9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms