Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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