Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Edf1Q9JMG1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edf1Q9JMG1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms