Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znhit3Q9CQK1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znhit3Q9CQK1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms