Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tsnaxip1Q99P25 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms