Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smg8Q8VE18 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Smg8Q8VE18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg8Q8VE18 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms