Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTA9

Eif4e1b, Eukaryotic translation initiation factor 4E type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4e1bQ3UTA9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif4e1bQ3UTA9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif4e1bQ3UTA9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif4e1bQ3UTA9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif4e1bQ3UTA9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif4e1bQ3UTA9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eif4e1bQ3UTA9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms