Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sdr16c6Q05A13 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdr16c6Q05A13 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 765 ms