Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Kif3aP28741 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif3aP28741 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms