Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NelfeP19426 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NelfeP19426 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NelfeP19426 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms