Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spi1P17433 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spi1P17433 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spi1P17433 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spi1P17433 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spi1P17433 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spi1P17433 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms