Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mfsd4b4J3QNS5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms